En casi dos años del actual sexenio el Ejército ha tenido que pagar 16 millones de pesos en indemnizaciones por las muertes, lesiones y agravios de sus militares contra civiles, principalmente durante las operaciones contra el crimen organizado, en comparación, durante todo el sexenio de Felipe Calderón, la Secretaría de la Defensa Nacional realizó un pago de 15.2 millones por indemnizaciones por la muerte de civiles en las que tuvo participación algún elemento de dicha dependencia, en todo el sexenio anterior el Ejército violó los derechos humanos de civiles en 50 operaciones, la misma cantidad fue pagada por la Sedena luego de que sus efectivos abusaran sexualmente de una mujer y asesinaran a otra en Ario de Rosales, Michoacán el 17 de diciembre de 2012, datos de la Sedena refieren que por cateos ilegales, lesiones, muerte a civiles, detenciones arbitrarias y tortura un total de 46 militares han sido sentenciados, 103 son procesados, 193 se encuentran en calidad de indiciados y 18 están prófugos.
